PUREfrex®是一系列重组无细胞蛋白质合成试剂,重组系统只与转录、翻译相关因素有关,使用者可以根据需要来自由调整反应混合物的成分,由于它只含有已知的蛋白质和底物,因此在下游应用中不必考虑高背景的影响。
什么是PURE?
PURE(Protein synthesis Using Recombinant Elements)系统技术是由东京大学的Takuya Ueda教授发明的重组无细胞蛋白质合成系统。
该反应系统仅由蛋白质、核糖体、氨基酸和NTPs组成。这些蛋白质是转录、翻译、氨酰化和能量再生所必需的。所有的蛋白因子和核糖体都是单独高度纯化的,并在缓冲液中与底物如氨基酸、NTPs和tRNAs组装。翻译因子包括: 起始因子IF1/IF2/IF3,延伸因子EF-Tu/EF-Ts/EF-G,释放因子RF1/RF2/RF3,核糖体再循环因子(RRF),20种氨酰tRNA合成酶(ARS),甲硫氨酰tRNA转移酶。
图1. PURE(Protein synthesis Using Recombinant Elements)系统技术示意图
该系统是仅由转录和翻译系统组成的,不像其他使用细胞裂解物的无细胞蛋白质合成系统。该系统没有未知蛋白质,成分可以随客户需要调整。
什么是PUREfrex?
PUREfrex是基于PURE系统技术的产品,该试剂盒主要由3种试剂组成。溶液I包含氨基酸、NTPs、其他小分子化合物和tRNAs。溶液II包含RNA聚合酶、翻译因子和其他蛋白质。溶液III含有纯化的核糖体。将纯化的组分以达到最大蛋白质合成活性的浓度混合。对于蛋白质合成,将编码自己感兴趣的蛋白质的DNA(或mRNA)加入到溶液I、II和III的混合物中,然后孵育反应混合物。PUREfrex减少了与蛋白质合成无关的污染物。例如,来自大肠杆菌的脂多糖减少到每ul反应混合物约0.1 EU。核糖核酸酶、β-半乳糖苷酶和其他污染蛋白的量也减少了。PUREfrex试剂中包含的所有翻译因子和其他蛋白质不包含任何标签序列。这使得可以使用任何标签序列来纯化和检测合成的蛋白质。
图2. PUREfrex与原始PURE系统中污染物比较
PUREfrex®试剂盒总共有3个系列:PUREfrex®1.0;PUREfrex®2.0;PUREfrex®2.1。
PUREfrex®1.0
2011年推出,反应溶液的成分信息是公开的,适用于产品定制等需要明确组成成分信息的研究。虽然使用 PUREfrex® 2.0 合成蛋白时的速度较快,但可能无法及时形成和折叠二硫键等导致不溶,此时使用合成速度较慢的PUREfrex® 1.0 效果可能更好。
PUREfrex®2.0
2015年推出,PUREfrex® 2.0改进了从大肠杆菌中纯化的所有组分的制备方法,并优化了因子的组成,使PUREfrex 2.0实现了比PUREfrex 1.0高2-10倍的蛋白质生产率。适用于需要合成大量蛋白及多种蛋白的研究。反应液成分信息保密。
PUREfrex®2.1
于2017年推出,在保留PUREfrex® 2.0 反应液组成的基础上,单独添加了还原剂,因此可根据添加的还原剂(和氧化剂)种类和数量来调整合成过程中的氧化还原状态。适用于需严格控制氧化还原状态的含二硫键结合的蛋白合成。
图3.PUREfrex® 1.0和PUREfrex® 2.0对比数据
图4.PUREfrex®2.0和PUREfrex®2.1成分对比
产品信息
产品名称 |
产品货号 |
规格 |
PUREfrex® 1.0 |
GFK-PF001-0.25-EX |
1 x 250 µl |
GFK-PF001-2ML-EX |
2 ml |
|
GFK-PF001-10ML-EX |
5 x 2 ml |
|
PUREfrex® 2.0 |
GFK-PF201-0.25-EX |
1 x 250 µl |
GFK-PF201-2ML-EX |
2 ml |
|
GFK-PF201-10ML-EX |
5 x 2 ml |
|
PUREfrex® 2.1 |
GFK-PF213-0.25-EX |
1 x 250 µl |
GFK-PF213-2ML-EX |
2 ml |
|
GFK-PF213-10ML-EX |
5 x 2 ml |
应用
使用PUREfrex®可合成各种活性蛋白,包括原核蛋白、真核蛋白、膜蛋白、含二硫键的蛋白质、含非天然氨基酸的蛋白质。PUREfrex®可用于以下研究领域,适用于各种蛋白质的小规模、高通量合成,也是蛋白质功能评估的机器学习平台的理想选择。
1. 核糖体展示技术
2. mRNA展示技术
3. 蛋白翻译机制研究
4. 蛋白质合成后的折叠
蛋白合成添加剂
根据您的蛋白质的性质,可以选择不同的添加剂,添加到PUREfrex®试剂盒中,改善蛋白的折叠和溶解性。
1.分子伴侣
分子伴侣像hsp70(如E. coli DnaK)有助于合成蛋白质的正确折叠。由于PUREfrex®试剂盒不含任何分子伴侣,一些蛋白质可能难以形成正确的构象,合成后为不溶性。在这种情况下,添加分子伴侣可能有助于增加溶解性和活性。
产品货号 |
产品名称 |
规格 |
描述 |
GFK-PF003-0.5-EX |
DnaK Mix |
500 µl Equivalents |
高度纯化的大肠杆菌来源的DnaK、DnaJ、GrpE蛋白以适当的浓度比例预混后的溶液 |
GFK-PF003-10ML-EX |
DnaK Mix |
5 x 2 ml Equivalents |
|
GFK-PF004-0.5-EX |
GroE Mix |
500 µl Equivalents |
经高度纯化的大肠杆菌来源的GroEL、GroES蛋白以适当的浓度比例预混后的溶液 |
GFK-PF004-10ML-EX |
GroE Mix |
5 x 2 ml Equivalents |
2.形成二硫键
对于某些蛋白质,如分泌蛋白,二硫键的形成对其稳定性或活性很重要。二硫键通常是由相邻半胱氨酸残基的巯基(SH-)氧化形成的。因此,氧化环境是形成二硫键所必需的。此外,二硫键异构酶(如E. coli DsbC)可以催化二硫键交换,也是形成半胱氨酸正确配对所必需的。
产品货号 |
产品名称 |
规格 |
描述 |
GFK-PF005-0.5-EX |
DsbC Set |
500 µl Equivalents |
含有作为氧化谷胱甘肽(GSSG)和二硫键异构酶的大肠杆菌 DsbC |
GFK-PF005-10ML-EX |
DsbC Set |
5 x 2 ml Equivalents |
|
GFK-PF006-0.5-EX |
PDI Set |
500 µl Equivalents |
含有氧化谷胱甘肽(GSSG)、人源二硫键异构酶(PDI)和PDI的氧化酶Ero1α |
GFK-PF006-10ML-EX |
PDI Set |
5 x 2 ml Equivalents |
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